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Licenciado em Engenharia Zootécnica pela Universidade de Évora em 1981.  Pós graduação em Nutrição Animal e Reprodução pela Facultade Veterinaria de Zaragoza, Espanha, em 1982. Completou o grau de Mestre em Produção Animal da Universidade Técnica de Lisboa, em 1986 e o grau de Doutor em Ciências Agrárias-Ciência Animal) pela  Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro em 1999.Tem desenvolvido a sua carreira de investigação no INIAV-Santarém (antiga Estação Zootécnica Nacional). Atualmente é Investigador Auxiliar do Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, e exerce a sua atividade de Investigação na Unidade Estratégica de Biotecnologia e Recursos Genéticos nas seguintes áreas: exames andrológicos a reprodutores, recolha, avaliação morfofuncional de ejaculados e tecnologia do sémen em pequenos ruminantes; protocolos de diluição e  conservação de sémen (refrigeração e criopreservação); Criopreservação de sémen de pequenos ruminantes de raças autóctones para o Banco Português de Germoplasma Animal e de outras especias pecuárias ; imunologia reprodutiva, sazonalidade de reprodução, taxa de ovulação, diagnóstico de gestação por ultrassonografia; métodos tradicionais (utilização de hormonas) ou sem utilização de produtos hormonais (bioestimulação, efeito macho, manipulação do fotoperíodo e implantes de melatonina)  no controlo da reprodução, endocrinologia da reprodução, biotecnologias reprodutivas; inseminação artificial em pequenos ruminantes; fisiologia da reprodução e eficiência reprodutiva; avaliação e gestão reprodutiva em rebanhos de pequenos ruminantes. Tem experiência tanto como orientador científico de teses de licenciatura e mestrado, como revisor assíduo de revistas científicas nacionais e internacionais com referee e editor de 2 revistas internacionais. João Pedro Barbas foi responsável por três projetos financiados por fundos nacionais e colaborou em vários projetos com financiamento nacional ou internacional. Tem vários artigos publicados em revistas com arbitragem nacional e internacional, bem como várias comunicações em congressos e reuniões científicas na sua área de especialização. Durante a sua carreira, tem sido um colaborador ativo com Associações de Criadores de raças autóctones de pequenos ruminantes, em relação a tecnologias de reprodução, inseminação artificial, e criopreservação de sémen.